Un noyau sur graphe prenant en compte la stereoisomerie des molecules

Pierre-Anthony Grenier &
Luc Brun &
Didier Villemin.

L'etude des relations quantitatives structure-activite (QSAR) ou structure-propriete (QSPR) sont deux domaines de recherche actifs, ou le but est la prediction de proprietes de molecules. Dans ces domaines, les noyaux sur graphes permettent de combiner la representation naturelle des molecules par des graphes avec des methodes classiques d'apprentissage automatique tels que les machines a vecteurs de support. Malheureusement, le positionnement relatif des atomes dans l'espace peut etre different pour des molecules representees par un meme graphe, ces molecules peuvent donc avoir des proprietes differentes. Ces molecules sont appelees stereoisomeres. Les proprietes variant entre les stereoisomeres ne peuvent pas etre predites par les methodes habituelles basees sur des graphes simples. Dans cet article, nous presentons une nouvelle representation des molecules qui prend en compte la stereoisomerie et nous proposons un noyau entre ces structures permettant de predire des proprietes liees a la stereoisomerie.